ارجاع پرونده ها در دادگاه نظامی درغیاب رییس سازمان قضایی استان، به عهده معاون و در غیاب وی به عهده روسای دادگاه های تجدیدنظر و نظامی یک و دو به ترتیب شماره شعبه است.