لاولکس وظایف شورای مرکزی بنیاد بشرح زیر است:
1 تعیین سرپرست یا رئیس بنیاد و پیشنهاد وی به امام برای تایید
2 تعیین خط مشی کلی و سیاست اجرایی امور بنیاد در سراسر کشور و همآهنگ کردن دفاتر مناطق و تنظیم برنامههای توسعه و بهبود فعالیت بنیاد.
3 مراقبت در حسن اداره بنیاد و نظارت درآمد و هزینههای دفاتر و رسیدگی به وضع مالی بنیاد و ترازنامه و حساب سود و زیان و بودجه و اصلاح یاتصویب آنها.
4 تعیین شوراهای منطقهای و تایید سرپرست یا مسئول هر دفتر و صدور ابلاغ آنان
5 تدوین آیین نامههای مربوط به بنیاد و اصلاح آنها.
6 رسیدگی به گزارشهای رئیس یا سرپرست بنیاد و شورای حقوقی و ناظران مالی و بازرسان و نظارت در حسن اجرای کار آنها
7 برقراری ارتباط با دولت و وزارتخانهها و سازمانهای دولتی و مالی کشور در جهت ایجاد همآهنگی بین برنامههای بنیاد و ایجاد یک شورایهمآهنگی.
8 تنظیم برنامههای اجتماعی برای جلب اعتماد و مشارکت هر چه بیشتر مردم از طریق کمک به مقاصد و هدفهای بنیاد.
9 ارجاع دعاوی به داوری و تعیین داور یا هیئتهای داوری طبق آیین نامه مخصوص
ماده ۱۱ لایحه قانونی اساسنامه بنیاد مستضعفان
هنوز نظریه، رأی یا نشستی که به این ماده استناد کرده باشد ثبت نشده است.