منابع مالی بنیاد عبارتند از: 1- کمکهای مقام معظم رهبری. 2- کمکها و اعتبارات مصوب در بودجه عمومی کشور. 3- درآمدهای حاصل از فعالیتهای اقتصادی بنیاد. 4- هدایا و کمکهای بنیاد مستضعفان و سایر اشخاص حقیقی و حقوقی.