رئیس سازمان بالاترین مقام اداری، مالی و فنی سازمان است و وظایف زیر را عهده‌دار می‌باشد: 1 عزل و نصب کلیه مدیران و کارکنان براساس آیین نامه‌های مربوط 2 پیشنهاد سیاست‌های راهبردی سازمان به شورای‌عالی استاندارد جهت تصویب 3 مدیریت و نظارت بر حفظ استقلال کامل ماموریت‌ها، وظایف و اختیارات 4 پیشنهاد تعرفه‌های مورد نیاز سازمان جهت تصویب به شورای‌عالی استاندارد 5 پیشنهاد دستورالعمل‌های اداری، مالی و استخدامی جهت تصویب به شورای عالی استاندارد بر اساس قوانین و مقررات مربوطه 6 نظارت بر حسن جریان امور و اجرای قوانین و مقررات در سازمان 7 بررسی و اجرای دستورالعمل و روشهای اجرایی سازمان و واحدهای تابعه منطبق بر قوانین و همچنین مقررات مالی، اداری و استخدامی مصوب شورای‌عالی 8 تلاش در جهت خودکفایی مالی از طریق ارائه خدمات و تعرفه‌های مصوب آن و کاهش وابستگی منابع مورد نیاز سازمان و واحدها و مراکز تابعه به بودجه عمومی کشور 9 شرکت در شوراها و مجامعی که بر اساس قانون، عضویت آنها را عهده‌دار می‌باشد. تبصره رئیس سازمان مجاز است بخشی از اختیارات خود را به معاونان، رؤسای مراکز و مدیران استانی تفویض کند.